Gruppo di Lettura su Bioinformatica
A.A. 2006/07 - HOME PAGE
Primo incontro: Giovedi 5 ottobre
2006 ore 16.00 aula 218
Docenti:
http://www.disi.unige.it/person/MasulliF/didattica/bioinf-home06.html
Ultimo aggiornamento 11 settembre 2006
Corso:
Obiettivi
Audience
Prerequisiti
Organizzazione
Programma
Testi di Riferimento
Link utili
Pagina ad accesso riservato
(chiedere permesso di accesso ai docenti)
Orario (il corso si svolge nel primo
semestre): giovedi ore 16.00 -18.00 aula 218
I recenti progressi nel campo della
ricerca genomica stanno
cambiando
il modo di affrontare molti problemi della biologia; di conseguenza la
Bioinformatica sta assumendo un ruolo sempre più centrale, sia
per quanto riguarda la gestione e l'integrazione dei dati biologici
(sequenze di DNA e proteine, strutture proteiche, microarray,
proteomica, ecc.), sia per l'elaborazione dell'informazione che molto
spesso richiede lo sviluppo di procedure informatiche e algoritmi
nuovi.
Il corso costituisce una semplice introduzione alle principali
problematiche della Bioinformatica attraverso i seminari
presentati dai partecipanti e una attivita' di laboratorio
informatico personalizzato.
Il
corso e' rivolto in particolare agli studenti della Laurea
Specialistica in Informatica ed e' valutato come un corso di
Laboratorio Specialistico 1. Puo' esere seguito anche dagli studenti
del terzo anno della Laurea in Informatica e del Dottorato di
ricerca in Informatica. Questi ultimi integreranno i seminari con
un'attivita' da definire.
Programmazione. Elementi di calcolo delle
probabilita' e statistica.
Corsi collegati
Il corso e' collegato a vari argomenti trattati nei corsi di
Algoritmi Evolutivi,
Reti
Neurali, Apprendimento Statistico e Intelligenza Computazionale.
Il reading group si riunisce una volta alla
settimana. A ogni
riunione viene scelto a turno un partecipante che illustrera' il
testo la riunione successiva e guidera' la discussione e sara' a
disposizione durante la settimana per spiegazioni.
Ad ogni studente verra' assegnato un progetto di laboratorio
informatico al fine di giungere al numero di 6 crediti didattici.
Banche dati biologiche - Allineamento di
sequenze di acidi
nucleici e proteine - Allineamento multiplo di sequenze - Ricerca
di pattern e di motivi funzionali - Evoluzione molecolare - Analisi
strutturale delle proteine - Analisi della struttura secondaria
di molecole di RNA - Sequenziamento e analisi di genomi -
Genomica funzionale
G. Valle, M. Helmer
Citterich, M. Attimonelli, G. Pesole,
Introduzione alla bioinformatica, Zanichelli, 2003 (FIS 575 VAL
50) http://bioinformatics.cribi.unipd.it/testo/index.html
Link utili
Introduction
to biology, functional genomics and microarrays
INTRODUCTION TO GENETICS
GENE INTERACTIONS
DNA AND MOLECULAR GENETICS
HUMAN GENETICS
PROTEIN SYNTHESIS